A Famesp é uma fundação privada, sem fins lucrativos, com mais de 35 anos de existência. Em 2011, foi qualificada como Organização Social de Saúde, o que a possibilitou firmar contratos de gestão de equipamentos estaduais de saúde. Sua atuação, no entanto, não se restringe à gestão de serviços de saúde. A Famesp atua amplamente nas áreas de ensino e pesquisa, inclusive mantém um programa próprio de Residência Médica em áreas básicas (Clínica Médica, Cirurgia, Pediatria), e, por meio de diversas parcerias municipais, estaduais e federais desenvolve atividades de utilidade pública consistentes na prestação e desenvolvimento da assistência integral à saúde.
Instituída em 12 de março de 1981, no campus de Botucatu (SP) da Universidade Estadual Paulista (Unesp), a Famesp começou suas atividades em 30 de junho do mesmo ano atuando na gestão de recursos do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu (HCFMB). Essa parceria com o Hospital e com a FMB/Unesp perdura até os dias atuais e é a base sólida da atuação da Famesp e de toda sua experiência acumulada.